Efektivitas amoksisilin dalam mengobati periodontitis sangat terbatas. Memang benar bahwa periodontitis adalah patologi yang disebabkan oleh invasi bakteri pada periodontium, tetapi pengobatan terbaik untuk patologi ini bukanlah dengan menggunakan obat-obatan, tetapi untuk menghilangkan faktor penyebab penyakit periodontal. Penyakit periodontal adalah penyakit periodontium yang kronis dan merusak yang disebabkan oleh kebersihan mulut yang buruk dan adanya plak dan kalkulus dalam jumlah besar. Perawatan periodontal dasar, yang biasanya mencakup scaling supragingiva, pengikisan subgingiva dan root planing, adalah cara terbaik untuk mencapai periodontium yang sehat dan untuk mengontrol dan mencegah perkembangan periodontitis. Setelah membersihkan periodontium, Anda dapat mempertimbangkan untuk menerapkan beberapa obat anti-inflamasi untuk periodontium, umumnya salep minocycline hidroklorida sesuai, sedangkan untuk obat oral amoksisilin bukan obat oral yang lebih baik, umumnya untuk periodontitis, Anda dapat mempertimbangkan untuk menerapkan metronidazole untuk pengobatan anti-inflamasi, tetapi premisnya harus terlebih dahulu mengontrol plak dan kalkulus periodontium.