Perbedaan antara iodofor dan povidone iodine terutama adalah sebagai berikut: Pertama, objek penggunaannya berbeda, karena iodofor umumnya digunakan sebagai disinfektan untuk kulit, sedangkan povidone iodine umumnya digunakan sebagai disinfektan untuk selaput lendir kulit. Kedua, efek bakterisidal dari iodofor jauh lebih kuat daripada povidone iodine. Ketiga, jika digunakan untuk keamanan populasi, iodofor lebih aman daripada povidone iodine dan tidak memiliki efek samping yang merugikan. Yodium povidon dapat menyebabkan reaksi alergi pada kulit manusia dan tidak direkomendasikan untuk wanita hamil dan bayi baru lahir. Iodine volt lebih aman digunakan pada bayi baru lahir atau wanita hamil. Selain itu, povidone iodine tersedia dalam bentuk larutan oral yang cocok untuk ternak, sehingga umumnya digunakan untuk desinfeksi penyu. Iodofor dan povidone iodine adalah disinfektan, keduanya memiliki efek bakterisidal yang kuat terhadap virus atau bakteri, tetapi iodofor umumnya lebih sering digunakan dalam praktik klinis dan povidone iodine relatif lebih jarang digunakan.