Tingkat keberhasilan transplantasi sel punca berkaitan dengan jenis transplantasi dan jenis penyakit, misalnya, tingkat keberhasilan transplantasi autologus lebih dari 90%, alogenik 60%-70%, leukemia mieloid akut 50%-60%, dan limfoma sekitar 70%. Transplantasi sel punca dapat dibagi menjadi 2 jenis: transplantasi sel punca hematopoietik autologus dan transplantasi sel punca hematopoietik alogenik. 1. Transplantasi sel punca hematopoietik autologus sederhana dan memiliki tingkat keberhasilan yang tinggi, umumnya lebih dari 90%. 2. Tingkat keberhasilan HSCT alogenik adalah 60% ~ 70%, terutama karena transplantasi sumsum tulang atau darah tepi orang lain dapat menyebabkan terjadinya penyakit graft-versus-host. 3. Tingkat keberhasilan transplantasi sel punca bervariasi sesuai dengan jenis penyakitnya, misalnya 50%~60% setelah transplantasi sel punca untuk leukemia mieloid akut dan 70% setelah transplantasi sel punca untuk limfoma non-Hodgkin. Tingkat keberhasilan transplantasi terkait dengan kondisi pasien, fungsi organ, status fisik, reaksi autoimun, komplikasi transplantasi, situasi pencocokan donor dan tingkat remisi kondisi penerima, serta tingkat medis yang komprehensif dari rumah sakit transplantasi. Untuk penyakit yang sama, pasien dengan kondisi fisik yang berbeda dan tahap penyakit yang berbeda memiliki metode perawatan dan pengobatan yang berbeda, dan harus ditangani dengan cara yang terstandardisasi di bawah bimbingan dokter.