Pembedahan Penyakit Parkinson kini lebih mapan, yaitu implantasi stimulator listrik otak dalam, umumnya dikenal sebagai pembedahan alat pacu jantung otak, yang tidak terlalu invasif dan lebih aman. Pasien dinilai secara ketat sebelum operasi, dan jika mereka dianggap cocok untuk operasi, prosedur ini lebih efektif dan memiliki lebih sedikit efek samping. Beberapa pasien mungkin mengalami efek samping seperti mati rasa pada anggota tubuh, penglihatan kabur, dan perubahan suara, yang akan berangsur-angsur menghilang dengan menyesuaikan voltase, frekuensi, lebar denyut nadi, dan parameter lain di luar tubuh pada tahap selanjutnya. Secara klinis diyakini bahwa pasien Parkinson cenderung tidak mengalami efek samping setelah mereka melewati masa bahaya pembedahan.