Protrombin adalah langkah yang paling penting dan kritis dalam proses koagulasi yang terjadi di dalam tubuh dan juga dikenal sebagai faktor koagulasi II. Dalam semua proses koagulasi, baik jalur koagulasi eksogen maupun endogen, protrombin pada akhirnya diaktifkan, mengubah protrombinogen menjadi trombin aktif. Trombin kemudian mengaktifkan fibrinogen, mengubahnya menjadi fibrin aktif, yang ketika diaktifkan, membentuk multimer fibrin yang terakumulasi dalam pembuluh darah yang pecah untuk menghentikan pendarahan. Aktivasi trombin juga dengan cepat meningkatkan proses pembekuan, yang merupakan efek umpan balik positif yang mengarah pada percepatan lebih lanjut proses pembekuan dalam tubuh. Jadi, trombin memainkan peran penting dalam proses pembekuan tubuh.