Obat-obatan yang digunakan untuk mengobati AIDS dan tuberkulosis berbeda, tidak sama. Pertama, untuk pengobatan AIDS, ada lebih dari 30 agen anti-retroviral yang umum digunakan dalam enam kategori, yang diklasifikasikan sebagai penghambat transkriptase balik nukleosida, penghambat transkriptase balik non-nukleosida, penghambat protease, penghambat fusi, penghambat integrase, dan penghambat CCR5. Obat-obat ini secara maksimal dapat menghambat replikasi virus dan membangun kembali atau mempertahankan fungsi kekebalan tubuh. Obat kemoterapi TB terutama mencakup obat anti-tuberkulosis lini pertama (kelas) seperti streptomisin, isoniazid, rifampisin, pirazinamid, dan etambutol. Dengan demikian, mekanisme utama obat untuk pengobatan HIV terletak pada antivirus, sedangkan mekanisme utama obat untuk pengobatan TB terletak pada antimikroba, dan perbedaan di antara keduanya relatif besar.