Hubungan seks saat menstruasi dapat menyebabkan menstruasi yang berkepanjangan, peningkatan aliran menstruasi, endometriosis, peradangan ginekologi, dan lain-lain, yang umumnya tidak berhubungan dengan ada atau tidaknya kontrasepsi. Selama menstruasi, karena endometrium mengeluarkan darah dan juga terjadi penyempitan panggul, hubungan seks pada saat ini dapat merangsang pecahnya pembuluh darah kapiler, yang mengakibatkan menstruasi yang berkepanjangan atau peningkatan aliran menstruasi. Pada saat yang sama, endometrium yang luruh akan mudah untuk tumbuh di bagian tubuh yang lain, sehingga menyebabkan endometriosis. Saat menstruasi, karena daya tahan tubuh akan berkurang, melakukan hubungan seks akan lebih mudah membawa bakteri masuk ke dalam vagina, yang akan dengan mudah menyebabkan infeksi bakteri dan menyebabkan radang ginekologi, yang mengakibatkan endometritis, servisitis, vaginitis, radang panggul, dan lain-lain. Oleh karena itu, hubungan seksual harus dihindari selama menstruasi untuk menghindari efek buruk pada tubuh.