Proses implantasi blastokista melibatkan tiga langkah, yaitu pemosisian di dalam rahim, perlekatan pada endometrium, dan invasi. Bagi wanita yang hamil secara alami, blastosis akan berkembang menjadi blastosis dalam waktu sekitar satu minggu setelah penyatuan sperma dan sel telur, lalu masuk ke dalam rahim melalui tuba falopi. Ketika waktunya telah matang, blastokista akan menempel pada endometrium dan sel trofoblas akan berdiferensiasi dan menyerang endometrium untuk menyelesaikan proses implantasi embrio. Proses implantasi blastosis pada program bayi tabung mirip dengan pembuahan alami, hanya saja blastosis masuk ke dalam rahim melalui jalur yang berbeda.