Apakah kista mata harus dioperasi tergantung pada situasi yang sebenarnya: jika kista kecil dan jinak, operasi biasanya tidak diperlukan; jika kista besar atau ganas, operasi harus dipertimbangkan setelah diagnosis.
Kista mata hanya kista kecil, dan jinak, tidak menimbulkan dampak yang terlalu besar, umumnya tidak perlu melakukan perawatan bedah, penyebab utama pengobatan, seperti adanya infeksi bakteri, dapat dioleskan obat tetes mata levofloxacin, dengan siprofloksasin oral, azitromisin dan lain sebagainya.
Jika kista mata berukuran besar, atau jika terdapat lesi ganas yang serius yang sangat mempengaruhi penglihatan atau jika kista bersifat ganas, pembedahan dapat dipertimbangkan setelah didiagnosis, dan kista dapat diangkat melalui pembedahan.
Pasien kista mata harus mengikuti petunjuk dokter untuk menggunakan obat, pengobatan yang aman dan wajar, untuk mencegah reaksi yang merugikan yang disebabkan oleh kesalahan pengobatan.