Ketika kateter dimasukkan, mukosa uretra teriritasi oleh kateter dan menyebabkan respons nyeri mukosa lokal, sehingga nyeri dapat terjadi selama pemasangan kateter, terutama jika pasien tidak bekerja sama dengan baik, seperti ketika mukosa uretra atau sfingter uretra berkontraksi dengan keras setelah ketegangan yang berlebihan atau rasa sakit yang ringan, yang kemudian menyebabkan mukosa uretra melilit kateter dengan erat. Selama pemasangan kateter, rasa sakit meningkat untuk mengatasi resistensi mukosa, terutama pada pria dengan hiperplasia prostat gabungan yang memiliki berbagai tingkat penyempitan uretra, sehingga kateter uretra terasa sedikit atau sangat sakit saat melewati bagian yang mengalami penyempitan. Untuk beberapa pasien dengan striktur uretra eksternal, encopresis atau infeksi saluran kemih, juga dapat timbul rasa nyeri yang signifikan selama pemasangan kateter, yang disebabkan oleh iritasi pada mukosa lokal oleh kateter. Rasa sakit ini disebabkan oleh iritasi pada mukosa lokal. Biasanya diperlukan untuk mencegah infeksi setelah kateter dimasukkan, minum banyak air dan beradaptasi dengan kateter.