Risiko gastroskopi selama wabah relatif rendah karena rumah sakit akan memeriksa suhu tubuh pasien yang menjalani gastroskopi dan mensterilkan peralatan pemeriksaan. Rumah sakit akan secara ketat mengikuti peraturan pencegahan dan pengendalian wabah untuk mewajibkan pasien memakai masker dan menguji suhu tubuh mereka, dan gastroskopi hanya dapat dilakukan setelah suhu tubuh normal. Setelah gastroskopi akan disterilkan secara ketat dan instrumen pengujian didesinfeksi, hampir semua mikroorganisme akan dihilangkan dalam proses desinfeksi, sehingga gastroskopi selama epidemi umumnya tidak akan terinfeksi penyakit. Melakukan gastroskopi selama epidemi harus memperhatikan perlindungan pribadi yang baik, dan pergi ke rumah sakit biasa di bawah bimbingan dokter untuk pengujian, agar tidak menimbulkan konsekuensi yang merugikan.