Biaya gastroskopi kapsul adalah sekitar$3500. Dokter akan menggunakan alat yang dikontrol secara magnetis untuk mengontrol endoskopi kapsul di dalam tubuh dan mengubah arah pemeriksaan kapan saja, sehingga perut pasien dapat diperiksa secara menyeluruh. Kelebihannya adalah mudah dan nyaman dioperasikan, tidak menimbulkan rasa sakit dan non-invasif, serta tidak ada kontaminasi silang karena kapsul tidak dapat digunakan kembali, 1 kapsul untuk 1 orang. Namun, ada beberapa kekurangan: pertama, biaya pemeriksaan relatif tinggi; kedua, lesi yang ditemukan tidak dapat diambil secara langsung untuk biopsi dan perlu diganti dengan gastroskop elektronik yang dikalengkan untuk pemeriksaan ulang.