Tiroiditis dapat dibagi lagi menjadi beberapa jenis. Ada beberapa tiroiditis yang dapat sembuh sendiri dan yang lainnya tidak. Sebagian besar tiroiditis subakut, setelah fase hipertiroid dan hipotiroid dapat dipulihkan sedini mungkin tanpa pengobatan khusus tambahan. Tiroiditis septik, di sisi lain, membutuhkan pengobatan antibakteri yang agresif. Pada tiroiditis Hashimoto, pengobatan khusus diberikan tergantung pada stadium penyakitnya. Pada hipertiroidisme, pengobatan anti-hipertiroidisme diindikasikan, sedangkan pada hipotiroidisme, suplementasi tiroksin diindikasikan. Kesimpulannya, pengobatan tiroiditis selanjutnya harus ditentukan oleh jenis tiroiditis tertentu dan harus dianalisis berdasarkan kasus per kasus.