MRI kepala janin, yang dikenal sebagai MRI Kepala Janin, umumnya digunakan untuk menentukan apakah janin memiliki gangguan sistem saraf pusat atau apakah ia memiliki craniosynostosis, perdarahan intrakranial, atau kondisi lainnya. MRI kepala janin adalah tes kehamilan khusus yang tidak diperlukan untuk semua wanita hamil, dan hanya dilakukan setelah tes lain, seperti USG, menunjukkan bahwa bayi mungkin memiliki kelainan kepala. MRI tengkorak janin dapat digunakan untuk mendeteksi pseudokista paraventrikular janin, malformasi sinus dural janin, asimetri janin pada ventrikel lateral, iskemia tengkorak janin, dan malformasi korteks janin.