Hipoksia dapat menyebabkan berbagai disfungsi, dan dapat dibagi menjadi hipoksia akut dan kronis menurut durasi hipoksia. Hipoksia akut biasanya dikaitkan dengan pusing dan sakit kepala, telinga berdenging, kelemahan anggota badan, mual dan muntah, pernapasan yang dangkal dan cepat, serta peningkatan denyut jantung. Hal ini sebagian besar dipicu oleh penurunan konsentrasi oksigen di lingkungan sekitar, seperti keracunan karbon monoksida akut atau berada di ruangan tertutup. Jika keadaan hipoksia tidak membaik, gejalanya akan berangsur-angsur memburuk dan dapat menyebabkan hilangnya kesadaran dan kematian karena sesak napas. Sebagian besar hipoksia kronis adalah sekunder akibat penyakit kronis, seperti ensefalopati paru. Timbulnya penyakit ini dapat didahului oleh gejala prodromal: depresi, insomnia, keringat berlebihan; perubahan kepribadian, tiba-tiba banyak bicara atau diam, mudah tersinggung atau tertawa; gangguan berhitung. Seiring dengan memburuknya penyakit, gejala hipoksia ringan dapat muncul: kelainan mental seperti kesurupan, ketidakpedulian, mengantuk dan kegembiraan, tetapi tidak ada tanda-tanda neurologis yang positif. Gejala hipoksia sedang seperti koma dangkal, delirium, otot berkedut, oedema umum, dan tidak responsif terhadap rangsangan dapat muncul saat lesi terus memburuk. Jika hipoksia parah terjadi, gejala-gejala seperti kongesti konjungtiva dan oedema, keringat umum, hilangnya respons terhadap berbagai rangsangan, pupil melebar atau sempit, kejang-kejang epilepsi, koma, dll., dan muntahan berwarna kopi dapat terjadi sebagai akibat dari gabungan perdarahan gastrointestinal bagian atas. Jika tidak diobati, ini dapat dengan cepat menyebabkan kematian. Hipoksia serebral menyebabkan berbagai tingkat kerusakan pada sel-sel otak dan perlu diobati segera setelah terjadi.