Pada tahap awal emboli serebral, tidak terlihat pada CT karena hanya jaringan otak yang menjadi nekrotik dan sel-sel otak yang sesuai yang dipersarafi oleh arteri serebral menjadi nekrotik, yang hanya dapat dilihat pada CT. Biasanya hanya setelah 24 jam emboli otak dapat terlihat pada CT imaging. Diagnosis emboli serebral tidak tergantung pada CT saja, tetapi juga pada riwayat medis dan pemeriksaan fisik pasien, dan, jika perlu, pada MRI kepala untuk memperjelas diagnosis.