Hasil positif palsu dapat terjadi dengan Carbon 13 Breath, terutama karena efek dari obat-obatan terkait atau jika tes dilakukan setelah makan. Carbon 13 Breath membutuhkan puasa minimal 6 jam, penghentian antibiotik minimal 4 minggu, penghentian penghambat pompa proton dan bismut minimal 2 minggu, dan penghentian obat herbal terkait sebelum tes. Hasil positif palsu dapat terjadi jika tes napas karbon 13 dilakukan tanpa mengikuti persyaratan persiapan di atas. Selain hasil positif palsu, ada juga hasil negatif palsu, seperti ketika antibiotik digunakan sebelum tes, yang mengakibatkan penekanan H. pylori. Ada beberapa cara untuk mendeteksi H. pylori, seperti tes urease cepat yang dilakukan di bawah gastroskopi, pemeriksaan feses, tes antibodi serologis, dll. Pasien yang dicurigai menderita infeksi H. pylori dapat diuji lebih lanjut dengan cara-cara ini. Pasien yang diduga memiliki hasil positif palsu untuk H. pylori dengan tes napas karbon 13 perlu berkonsultasi dengan dokter untuk pengujian lebih lanjut.