Amputasi akar mengambil apa yang mungkin merupakan bagian dari akar dan jaringan periapikal yang sakit. Amputasi akar cocok untuk pasien dengan perawatan saluran akar yang gagal, pengisian saluran akar yang tidak dapat dihilangkan, saluran akar yang melengkung dan menyempit, instrumen saluran akar yang patah, ujung akar yang patah dan peradangan apikal yang kronis, yang harus dilakukan dengan sayatan miring ke dalam dan sayatan vertikal, metode flap konvensional, mengekspos lesi periapikal secara menyeluruh, mengambil jaringan yang berpenyakit di periapikal, debridemen menyeluruh, dan perataan permukaan akar. Ketika salah satu akar dari gigi berakar banyak mengalami poket periodontal yang sulit disembuhkan dan resorpsi tulang atau lesi bifurkasi akar yang parah, maka amputasi akar dapat dilakukan untuk mempertahankan akar dan mahkota gigi yang tersisa, sehingga dapat memperpanjang masa pakai gigi. Oleh karena itu, pasien yang menjalani reseksi akar harus memperhatikan kebersihan mulut dalam kesehariannya dengan menyikat gigi setelah tiga kali makan dan sebelum tidur, serta berkumur setelah makan.