Sejumlah kecil iodofor untuk desinfeksi mungkin tidak berbahaya, tetapi jika terlalu banyak bisa berbahaya. Karena iodofor terutama digunakan untuk desinfeksi lokal dalam jumlah yang relatif kecil, jika terlalu banyak iodin yang tidak sengaja tertelan dapat mengiritasi selaput lendir lokal, mengakibatkan reaksi inflamasi, kemacetan lokal, oedema atau bahkan keracunan, gejala gastrointestinal, mual, muntah, atau rasa tidak nyaman di perut bagian atas. Sangat sedikit pasien yang alergi terhadap yodium dan dapat mengalami anafilaksis, yang lebih berbahaya dan memerlukan pengobatan anti alergi dan anti mual. Mereka yang telah menelan terlalu banyak harus segera dibawa ke rumah sakit dan tidak dapat ditangani secara pribadi.