Gejala-gejala stomatitis termasuk ulkus, herpes atau pseudomembran pada mukosa mulut. Stomatitis adalah reaksi inflamasi pada selaput lendir rongga mulut, yang paling sering disebabkan oleh infeksi bakteri, virus atau jamur, seperti stomatitis ulseratif, stomatitis herpes, stomatitis alergi obat dan stomatitis Candida. Stomatitis ulseratif biasanya terlihat pada lidah dan mukosa bukal. Penyakit ini dimulai dengan kongesti atau oedema dan secara bertahap berkembang menjadi ulkus vesikular dengan pseudomembran putih atau kuning dari cairan inflamasi dan reaksi lokal yang menyakitkan. Biasanya sembuh secara spontan dalam waktu seminggu atau lebih. Stomatitis herpes paling sering disebabkan oleh infeksi virus herpes simpleks dan paling sering terjadi di sudut mulut. Ini dimulai sebagai kelompok papula pinpoint yang perlahan-lahan memecah untuk membentuk kerak kuning, kadang-kadang dengan rasa sakit yang parah atau pembukaan mulut yang terbatas. Stomatitis alergi obat paling sering disebabkan oleh pemberian obat tertentu dan biasanya berkembang dua puluh empat jam setelah minum obat, dengan kemacetan atau edema di daerah selaput lendir. Stomatitis Candida paling sering disebabkan oleh infeksi jamur. Pada bayi baru lahir, perubahan pseudomembran putih di area selaput lendir dapat terhapus dan mengganggu pemberian makan normal, dan bayi akan cenderung menangis dan menolak untuk makan. Oleh karena itu, stomatitis dapat muncul sebagai ulkus di area mukosa, atau sebagai kerak edematosa, dan terkadang sebagai nyeri lokal.