Kanker hipofaring sulit untuk diobati karena gejalanya yang tidak mencolok pada tahap awal, tingkat keganasan yang tinggi, mudah bermetastasis dan kambuh, tetapi tidak dapat dikatakan sebagai kanker yang paling sulit untuk diobati.
Pada tahap awal kanker hipofaring, tidak ada manifestasi klinis yang jelas, dan beberapa pasien mungkin memiliki sensasi benda asing di faring, yang mirip dengan gejala faringitis kronis, sehingga mudah untuk salah didiagnosis dan dihilangkan, dan kemudian akan mudah untuk menunda pengobatan. Ketika kanker hipofaring menunjukkan gejala klinis yang jelas, lesi sebagian besar akan berkembang ke tahap menengah atau akhir, dan periode pengobatan yang optimal akan terlewatkan, dan efek terapeutiknya buruk.
Kanker hipofaring sangat ganas, sebagian besar merupakan karsinoma sel skuamosa, rentan terhadap metastasis kelenjar getah bening leher, yang membuatnya lebih sulit untuk diobati, dan kanker hipofaring cenderung kambuh setelah operasi karena lokasi lesi yang khusus.
Kanker hipofaring sulit diobati dan memiliki prognosis yang buruk, setelah terdeteksi, seseorang harus secara aktif bekerja sama dengan dokter untuk mendapatkan pengobatan standar.