CT dapat dilakukan pada anak-anak, tetapi karena efek samping dari radiasi, penting untuk bersikap tegas mengenai indikasi CT pada anak-anak dan hanya melakukannya jika memang diperlukan untuk menghindari bahaya dari sinar-X, misalnya, jika anak mengalami perdarahan tengkorak atau jika anak memiliki lesi paru-paru yang serius, maka CT kepala atau CT dada harus dilakukan. Selain itu, tes non-radioaktif seperti MRI tengkorak juga dapat digunakan jika anak memiliki lesi tengkorak.