Setelah menjalani esofagoskopi, esofagoskop dimasukkan melalui mulut dan dapat menyebabkan mual, muntah, dan regurgitasi akibat iritasi selaput lendir di orofaring, sehingga dapat lebih atau kurang menyakitkan. Hal ini juga bervariasi pada setiap orang. Orang yang merokok memiliki tenggorokan yang lebih sensitif, sehingga rasa sakitnya lebih terasa saat menjalani esofagoskopi. Esofagoskopi sudah jarang digunakan saat ini karena hanya memungkinkan Anda untuk melihat lesi di kerongkongan. Jadi, saat ini, pada dasarnya gastroskopi elektronik tidak hanya memvisualisasikan lesi mukosa esofagus, tetapi juga lesi spesifik pada mukosa lambung dan duodenum pada saat yang bersamaan. Jika perlu, biopsi juga dapat dilakukan di bawah mikroskop atau prosedur mikroskopis dapat dilakukan pada waktu yang sama. Bagi mereka yang tidak dapat menjalani esofagoskopi atau gastroskopi, elektrogastroskopi tanpa rasa sakit dapat menjadi pilihan.