Rongga tulang belakang paling sering disebabkan oleh malformasi Chiari (herniasi subungual tonsil serebelar). Patogenesis malformasi Chiari dapat terjadi pada trimester ketiga janin, selama periode embrionik, ketika perkembangan tulang oksipital tertunda dan tertinggal karena hipoplasia bagian oksipital somit mesodermal, sementara otak kecil dan batang otak berkembang secara normal, sehingga memungkinkan struktur otak posterior yang berkembang secara normal mengalami hernia ke dalam kanal tulang belakang setelah lahir karena kompresi yang berlebihan pada fosa kranial posterior. Patogenesis malformasi yang dikombinasikan dengan kavitasi sumsum tulang belakang: teori hidrodinamika; teori pemisahan tekanan intrakranial dan intraspinal; teori infiltrasi parenkim sumsum tulang belakang cairan serebrospinal; terkait dengan saluran keluar cairan serebrospinal yang tidak normal pada area foramen magnum.