Nyeri perut dan keinginan untuk buang air besar secara terus-menerus berhubungan dengan disfungsi gastrointestinal dan gastroenteritis. Disfungsi saluran cerna menyebabkan lambung mempengaruhi pencernaan makanan. Iritasi pada lambung yang disebabkan oleh makanan yang tidak dicerna tepat waktu pada lapisan lambung dapat menyebabkan sensasi nyeri pada lambung. Beberapa pasien dengan gangguan pencernaan mengalami buang air besar yang hiperaktif, di mana isi usus dibuang dengan cepat, sehingga mengakibatkan buang air besar yang lebih sering, serta kembung dan mencret. Pada saat timbulnya penyakit IBS, terjadi peradangan pada selaput lendir sistem pencernaan. Peradangan ini menyebabkan iritasi pada otot polos dinding lambung, yang menyebabkan kejang dan kontraksi pada dinding lambung dan menimbulkan rasa sakit pada perut. Otot polos sistem usus menjadi kejang dan berkontraksi karena iritasi parah, dan isi usus dikeluarkan dengan cepat karena kontraksi spasmodik dinding usus, sehingga meningkatkan frekuensi buang air besar.