1. Leukemia dalam remisi total; 2. Anemia aplastik dengan donor yang kompatibel sepenuhnya; jika terapi konvensional hemiphasic tidak efektif dan tergantung transfusi; 3. Limfoma stadium III-IV; 4. Leukemia refrakter yang kambuh; 5. Sindrom myelodysplastic. Transplantasi tidak diperlukan untuk leukemia limfoid akut risiko rendah atau menengah pada anak-anak, tetapi transplantasi lebih efektif daripada kemoterapi pada pasien risiko tinggi atau jenis refraktori yang kambuh.