Minyak seabuckthorn terutama dibagi menjadi minyak biji seabuckthorn dan minyak buah seabuckthorn, perbedaan utama antara keduanya adalah bahan baku yang digunakan berbeda, sifat dan rasanya berbeda, bahan intinya berbeda dan harganya berbeda.
Minyak biji seabuckthorn dan minyak buah berbeda dalam bahan bakunya, minyak biji seabuckthorn diekstraksi dari biji seabuckthorn dengan teknologi ekstraksi superkritis karbon dioksida, sedangkan minyak buah seabuckthorn diekstraksi dari pericarp seabuckthorn dan bubur kertas dengan teknologi superkritis karbon dioksida.
Minyak biji seabuckthorn dan minyak buah memiliki beberapa perbedaan sifat dan rasa. Minyak biji seabuckthorn berwarna kuning kecoklatan hingga merah kecoklatan, dengan rasa yang lebih menyegarkan, teksturnya ringan dan halus, tidak berbutir-butir, dan terdapat sedikit fenomena menggantung saat diguncang perlahan. Minyak buah seabuckthorn berwarna merah kecoklatan, dengan rasa seabuckthorn yang kental, rasa yang lembut, sisa rasa yang penuh, waktu retensi wewangian yang lama, dan hiasan dinding yang jelas saat diguncang dengan lembut.
Dalam hal bahan inti, minyak biji seabuckthorn memiliki kandungan asam lemak tak jenuh, protein, asam amino, vitamin, flavonoid total dan polifenol yang lebih tinggi, sedangkan minyak buah seabuckthorn memiliki kandungan asam palmitoleat, karotenoid, dan asam organik yang lebih tinggi.
Dari segi harga, harga minyak biji seabuckthorn lebih tinggi dari minyak buah seabuckthorn karena proporsi biji seabuckthorn dalam buah seabuckthorn kecil dan rendemen minyaknya rendah.