Gastroskopi dapat dibagi menjadi dua jenis: gastroskopi umum dan gastroskopi tanpa rasa sakit. Kedua jenis gastroskopi ini merupakan tes invasif dan pasien mungkin mengalami berbagai tingkat ketidaknyamanan. Gejala yang paling umum terjadi setelah gastroskopi adalah rasa sakit yang samar-samar pada perut, yang berangsur-angsur menghilang dalam waktu 2-3 hari, dan kadang-kadang mual, kelelahan dan pusing, yang juga akan kembali normal dalam waktu beberapa hari. Karena gastroskopi dilakukan melalui saluran pencernaan, terkadang dapat mengiritasi tenggorokan dan menyebabkan sakit tenggorokan. Secara umum, reaksi ketidaknyamanan ini ringan dan akan kembali normal dalam beberapa hari, tetapi penting untuk mencari bantuan medis jika Anda mengalami tinja berwarna hitam atau jika ketidaknyamanannya sangat kuat dan berkepanjangan setelah gastroskopi.