Gejala klinis pilek akibat virus dan bakteri sangat mirip, dan cara khusus untuk membedakan kedua jenis pilek ini adalah sebagai berikut: 1. Membedakan dari sekresi, fenomena dahak nanah sebagian besar adalah infeksi bakteri yang menyebabkan pilek, sedangkan dahak infeksi saluran pernafasan akibat virus tidak bernanah. 2. Membedakan dari jumlah sel darah putih, biasanya saat infeksi bakteri, neutrofil darah rutin pasien dan jumlah sel darah putih total akan meningkat, sementara infeksi virus, jumlah sel darah putih total normal atau rendah. 3. Gejala lain, biasanya infeksi saluran pernapasan atas bakteri, pasien dengan gejala sakit tenggorokan lebih jelas, sedangkan infeksi virus akan muncul lebih banyak pilek, dan mungkin juga muncul kongesti konjungtiva, diare dan gejala lainnya. 4. Waktu timbulnya, biasanya infeksi bakteri yang disebabkan oleh flu, onsetnya mungkin relatif lambat, mungkin juga lebih cepat, gejala sistemik Reaksinya lebih jelas, demam tidak jelas di awal, dan kondisinya memburuk setelah 2-3 hari, sedangkan timbulnya infeksi virus lebih cepat.