Ada masa inkubasi untuk konjungtivitis dan lamanya masa inkubasi bervariasi antara berbagai jenis konjungtivitis. Masa inkubasi untuk beberapa jenis yang umum adalah sebagai berikut: 1. Konjungtivitis hiperakut dengan infeksi gonokokus memiliki masa inkubasi yang sangat singkat, biasanya hanya beberapa jam. Masa inkubasi biasanya hanya beberapa jam, dan sangat menular, biasanya karena pasien memiliki infeksi gonokokal genital dan tidak mencuci tangan setelah menyentuh alat kelaminnya dan menggosok matanya, yang menyebabkan infeksi gonokokal konjungtiva, dan gejala konjungtivitis terlihat jelas 2-3 jam setelah menggosok mata. 2. Konjungtivitis bakteri, biasanya dengan masa inkubasi sekitar 3 hari, ditularkan melalui kontak, misalnya, dengan berbagi produk kebersihan pribadi seperti waslap dan baskom dengan pasien. 3. Konjungtivitis virus, yang biasanya memiliki masa inkubasi yang sedikit lebih lama, yaitu 5-7 hari, tetapi masing-masing jenis konjungtivitis virus mungkin memiliki masa inkubasi yang lebih pendek, seperti konjungtivitis hemoragik epidemik, yang biasanya memiliki masa inkubasi 1-3 hari.