Kolik bilier terjadi pada sekitar 2% batu empedu ‘asimtomatik’ setiap tahunnya. Batu-batu kecil dapat jatuh ke dalam saluran empedu umum dan mengalir ke duodenum, dan setiap drainase dapat merusak empedu. Sfingter hepatopankreas di ujung saluran umum dapat rusak setiap kali batu diangkat. Pengangkatan batu berulang-ulang dapat mengakibatkan penyempitan ujung saluran empedu umum, sekunder untuk batu saluran empedu umum dan pankreatitis bilier. Batu-batu besar yang bersarang dan menekan kantung empedu dan organ-organ yang berdekatan dapat membentuk fistula bilier seperti fistula kolesistoduodenum, fistula kolesistokoledokokal transversal dan fistula saluran empedu umum. Sekitar 0,5-1% batu kandung empedu mengalami komplikasi kanker kandung empedu. Untuk batu yang berukuran lebih besar dari 3 cm, usia di atas 50 tahun, silsilah keluarga tumor, ketebalan dinding kandung empedu yang lebih besar dari 1 cm, dan perubahan magnetik pada kandung empedu harus dianggap sebagai faktor risiko tinggi untuk kanker kandung empedu.