Infeksi saluran kemih dapat diobati dengan amoksisilin oral, tetapi amoksisilin bukanlah obat terbaik untuk mengobati infeksi saluran kemih. Amoksisilin memiliki efek bakterisidal terbaik pada Streptococcus haemolyticus, Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus, dan kokus lainnya, dan juga memiliki efek membunuh tertentu pada Escherichia coli, Proteus mirabilis, atau Enterococcus faecalis. Sebagian besar infeksi saluran kemih mungkin merupakan infeksi seperti E. coli, jadi mengonsumsi amoksisilin untuk infeksi saluran kemih bukanlah pilihan terbaik. Kuinolon dan sefalosporin adalah antibiotik yang direkomendasikan untuk infeksi saluran kemih. Untuk infeksi saluran kemih yang berulang, diperlukan kultur bakteri urin, dan berdasarkan hasil kultur bakteri, pengobatan antibiotik yang paling sensitif dipilih untuk mencapai hasil terbaik. Pasien dengan infeksi saluran kemih harus minum lebih banyak air dan buang air kecil lebih sering selama masa pengobatan untuk meningkatkan efek pembilasan fisik urin pada saluran kemih, yang membantu dalam pengobatan infeksi saluran kemih. Pasien dengan infeksi saluran kemih harus menggunakan obat di bawah bimbingan dokter, dan tidak boleh menggunakan obat sendiri.