Spina bifida kongenital dapat dioperasi, tetapi tidak semua pasien memerlukannya, dan perlu dinilai dari gejalanya dan sebagainya. Jika spina bifida kongenital tidak menunjukkan gejala, umumnya tidak diperlukan pengobatan, namun jika gejalanya jelas, maka diperlukan pengobatan, seperti tingkat kelumpuhan yang berbeda pada tungkai bawah, disfungsi sfingter anus dan kandung kemih serta kantung tulang belakang yang tipis, rongga kantung secara bertahap membesar, dan ada risiko pecah atau sudah pecah, maka diperlukan pengobatan bedah dini. Bayi dengan dinding kista yang lebih tebal dan massa yang kecil tanpa kelainan yang jelas pada gerakan tungkai bawah bilateral dapat diobati dengan pembedahan bila mereka dapat mentoleransi pembedahan. Spondilolistesis kongenital harus segera ditangani di rumah sakit biasa, dan dokter akan menentukan apakah pembedahan diperlukan sesuai dengan kondisi spesifiknya.