Virus hepatitis B telah terintegrasi dengan inti sel hati manusia, setelah kematian sel hati yang menua, sel hati yang baru dibuat dan virus hepatitis B diregenerasi bersama dengan sel hati. HBVDNA adalah penanda replikasi virus hepatitis B. Ada beberapa tingkat replikasi yang berbeda, cepat dan lambat, tinggi dan rendah. Titer HBVDNA yang tinggi hanya menunjukkan kemampuan replikasi yang kuat dari virus hepatitis B dan tingkat penularan virus hepatitis B. HBVDNA merupakan syarat untuk pengobatan antivirus, tetapi bukan kondisi yang menentukan. Terapi antivirus hanya dapat diberikan jika HBVDNA mencapai tingkat titer tertentu sementara ALT meningkat hingga dua kali lipat dari batas atas normal atau lebih tinggi atau jika terdapat G2 atau S2 pada pungsi hati atau fibrosis elastis hati sedang (kekakuan hati); pasien dengan bukti sirosis dapat diobati dengan terapi antivirus tanpa memperhatikan HBV DNA dan ALT. HBVDNA juga dapat digunakan sebagai salah satu kriteria untuk menilai kemanjuran terapi antivirus. Penurunan HBVDNA secara bertahap menunjukkan bahwa terapi antivirus efektif; jika HBVDNA tidak menurun setelah berbulan-bulan terapi antivirus, ini menunjukkan kemanjuran yang buruk; jika HBVDNA menurun dengan cepat dalam jangka pendek, ini menunjukkan kemanjuran antivirus yang lebih baik; namun, jika HBVDNA menurun dan kemudian meningkat kembali hingga mencapai 10 kali lipat, ini menunjukkan terjadinya resistensi obat. Singkatnya, perlu tidaknya pengobatan antivirus tidak tergantung pada HBV DNA, dan jika syarat-syarat pengobatan tidak terpenuhi, pengobatan tidak boleh sembarangan diberikan, tetapi harus menunggu waktu yang tepat, jika tidak, pengobatan hanya akan berjalan ke arah yang berlawanan, mengurangi kemanjuran pengobatan, memicu resistensi obat, mengganggu keseimbangan kekebalan tubuh sendiri, dan bahkan seumur hidup tidak bisa disembuhkan.