Cacat septum ventrikel janin memiliki tingkat kesembuhan sekitar 30-50 persen. Setelah cacat septum ventrikel janin terjadi, biasanya lebih baik untuk tidak gugup pada awalnya, dan mengamati kondisinya dengan cermat. Karena jantung masih berkembang pada tahap janin, beberapa pasien mungkin dapat menutup sendiri defek septum ventrikel setelah lahir, bahkan jika defek septum ventrikel tidak menutup setelah lahir dan masih ada, beberapa pasien mungkin dapat menutup sendiri defek tersebut seiring dengan berjalannya waktu. Secara keseluruhan, pasien dengan defek septum ventrikel yang lebih kecil memiliki tingkat penyembuhan sendiri yang lebih tinggi, dan pasien dengan defek yang lebih besar memiliki tingkat penyembuhan sendiri yang lebih rendah. Cacat di bawah 5 mm umumnya memiliki tingkat penyembuhan sendiri sekitar 50 persen, dan sebagian besar sembuh dalam waktu satu tahun. Tentu saja, jika cacat tidak sembuh dalam waktu lebih dari satu tahun, kecil kemungkinannya untuk sembuh kembali. Jika seorang anak memiliki cacat septum ventrikel, penting untuk memantau anak secara ketat dan mencari bantuan medis jika ada kelainan.