Gejala klinis miokarditis pediatrik tergantung pada tingkat keparahan penyakit dan usia anak. Pada kasus yang parah, gagal jantung, aritmia ganas, syok kardiogenik dan bahkan kematian dapat terjadi. Sebagian pasien juga dapat berkembang menjadi kardiomiopati dilatasi, karena mereka belum pulih dengan baik dari tahap awal. Jika bayi baru lahir menderita miokarditis, gejalanya sering kali parah dan mungkin termasuk demam tinggi, mengi, dispnea, sianosis, dan sering kali komplikasi hati dan paru serta neurologis. Pada pemeriksaan, anak-anak dengan miokarditis mungkin mengalami takikardia, beberapa mungkin memiliki suara jantung yang rendah dan irama gallop, ronki basah mungkin terdengar di paru-paru, dan pada kasus yang parah, penurunan tekanan darah dan denyut nadi yang lemah mungkin terlihat. Selain kelainan-kelainan ini, sebagian pasien mungkin juga memiliki hati atau limpa yang besar. Anak-anak dengan miokarditis mungkin mengalami peningkatan isoenzim kreatin kinase dan troponin, dan bayangan jantung yang membesar dapat terlihat pada x-ray. Pada awal perjalanan penyakit, titer antibodi IgM spesifik dalam darah di atas 1:128. Ultrasonografi jantung dapat menunjukkan pembesaran atrium dan pembuluh darah, dan pada sebagian pasien, gangguan fungsi sistolik ventrikel. Tes standar emas untuk mengkonfirmasi miokarditis adalah biopsi miokard. Fase akut miokarditis pada anak-anak memerlukan istirahat total di tempat tidur sehingga beban pada jantung dapat dikurangi. Selain istirahat yang cukup, obat-obatan yang menyehatkan otot jantung, seperti fruktosa 1,6-difosfat, dapat digunakan untuk membantu meningkatkan metabolisme energi miokard dan memperbaiki sel-sel yang rusak. Imunoglobulin dosis tinggi juga dapat digunakan untuk mengurangi kerusakan sel otot jantung melalui imunomodulasi. Pasien yang mengalami aritmia dan gejala gagal jantung selama perjalanan penyakit diobati terutama dengan dukungan simtomatik.