Pengujian jaringan patologis gastroskopi untuk H. pylori dan tes napas karbon 13 atau karbon 14 merupakan metode yang akurat untuk mendeteksi H. pylori. Penghentian antibiotik selama 2 minggu dan obat lambung selama 4 minggu dianjurkan sebelum pengujian. Penggunaan antibiotik baru-baru ini seperti klaritromisin, levofloksasin, metronidazol dan tinidazol, penghambat pompa proton seperti omeprazol dan pantoprazol, dan obat-obatan berbasis titin seperti famotidin dan ranitidin, termasuk bismut kalium sitrat dan bismut pektin dapat memengaruhi keakuratan tes napas karbon 13 atau karbon 14.