Penyebab sakit kepala setelah berlari terutama adalah sebagai berikut: pertama, suplai darah yang tidak mencukupi ke arteri serebral, sebagian besar suplai darah tubuh ke anggota tubuh selama proses berlari, olahraga berat kemungkinan besar menyebabkan iskemia transien dan kekurangan oksigen ke otak setelah berlari, sehingga menyebabkan gejala sakit kepala, yang dapat diredakan dengan istirahat yang cukup dan penyesuaian pernapasan. Kedua, hipoglikemia, jika olahraga berat dilakukan di lingkungan yang lapar atau di lingkungan yang tidak sesuai, mudah untuk mempercepat metabolisme energi dalam tubuh, dan ketika otak tidak bisa mendapatkan energi yang cukup, mudah menyebabkan pasokan oksigen dan suplai darah yang tidak mencukupi, sehingga menyebabkan gejala sakit kepala. Ketiga, hipertensi, ketika berolahraga dengan giat, dapat dengan mudah menyebabkan tekanan darah meningkat, mengakibatkan sakit kepala vasodilatasi, sebagian besar pada pasien dengan penyakit yang mendasari hipertensi. Ketika sakit kepala terjadi, tekanan darah perlu segera dipantau, dan pada kasus yang parah, tekanan darah dikontrol dengan obat antihipertensi, dan gejalanya dapat berkurang atau hilang setelah stabilisasi.