Ada banyak efek samping dari sunat, termasuk tumbuh ke dalam, infeksi, stenosis uretra, dan kanker. 1. Jebakan: Jika pembukaan kulup kecil, setelah membalikkannya secara paksa, alur koronal penis dapat tercekik, mengakibatkan iskemia pada kepala penis dan kulup, atau bahkan ulserasi dan nekrosis, dalam hal ini perlu pergi ke rumah sakit sesegera mungkin untuk melepaskan jebakan. 2. Infeksi: kulup mudah menyimpan kotoran di bawah kulit yang menyebabkan infeksi bakteri, sehingga terjadi infeksi, kali ini ikuti petunjuk dokter untuk memberikan pengobatan anti infeksi seperti tablet cefprozil yang dapat didispersikan, untuk mengendalikan peradangan, operasi sunat elektif. 3. Penyempitan lubang uretra: Pembukaan kulup yang kecil atau infeksi berulang akan dengan mudah menyebabkan penyempitan lubang uretra, yang akan menyebabkan gejala seperti kesulitan buang air kecil dan buang air kecil yang tidak tuntas. 4. Kanker: Infeksi kulup berulang dan stimulasi jangka panjang pada sisik kulup akan menyebabkan proliferasi sel yang berlebihan pada penis, sehingga meningkatkan kejadian tumor penis. Sunat harus dikonsultasikan di bagian urologi sesegera mungkin untuk diagnosis dan pengobatan dini.