Tidak ada pengobatan khusus untuk penis pendek, dan pengobatan harus ditentukan oleh penyebab penyakit.
Ukuran penis itu sendiri sangat bervariasi dari satu individu ke individu lainnya, dan pendeknya penis pada orang dewasa tidak dapat diubah dengan obat-obatan, apa pun penyebabnya. Hanya pada masa pubertas sebelum kematangan perkembangan penis sebelum penerapan obat mungkin efektif, jika disebabkan oleh rendahnya tingkat androgen tubuh, dapat di bawah bimbingan dokter untuk menggunakan obat hormon androgenik, seperti testosteron undecanoate, dan sebagainya.
Jika penis tersembunyi, atau perkembangan penis pendek bawaan lahir dapat dilakukan tindakan pembedahan.
Jika Anda memang memiliki penis pendek, Anda harus pergi ke rumah sakit secara teratur untuk melakukan pemeriksaan dan mengambil tindakan pengobatan yang tepat sesuai dengan petunjuk dokter, hindari penyalahgunaan obat-obatan atau produk kesehatan, dan tidak menggunakan resep dan metode pengobatan yang tidak ilmiah.