Gastroenteritis akut yang disebabkan oleh sindrom iritasi usus besar lebih disukai ceftriaxone dan pengobatan anti-infeksi lainnya untuk gastroenteritis akut, dan kemudian sindrom iritasi usus besar terutama merupakan pengobatan simtomatik, seperti sakit perut diberikan skopolamin, tetapi juga penggunaan obat psikotropika. Gastroenteritis akut, dapat menjadi pemicu sindrom iritasi usus besar, kecuali bahwa sindrom iritasi usus besar tidak terjadi secara tiba-tiba, sering kali ada dasar patologis tertentu, seperti kelainan gerakan saluran usus itu sendiri, kelainan sensorik viseral, atau gangguan mental psikologis. Pertama-tama, faktor penyebabnya harus dihilangkan, dan gastroenteritis akut harus diobati dengan baik, biasanya menggunakan pengobatan anti-infeksi dengan sefalosporin seperti ceftriaxone dan antibiotik kuinolon seperti levofloxacin. Pengobatan sindrom iritasi usus besar meliputi mereka yang mengalami nyeri perut dapat diberikan skopolamin dan analgesik antispasmodik antikolinergik lainnya, mereka yang mengalami kembung dapat diberikan domperidone, mosapride untuk meningkatkan dinamika gastrointestinal, diare dapat diberikan montelukast untuk menghentikan diare, bifidobakteri untuk mengatur flora usus, dan konstipasi dapat diberikan laktulosa dan obat-obatan lainnya. Gastroenteritis akut yang disebabkan oleh sindrom iritasi usus besar harus pergi ke rumah sakit, di bawah bimbingan perawatan dokter. Jangan mengobati sendiri untuk menghindari reaksi yang merugikan.