Alasan mengapa asam amino berbeda ditentukan oleh gugus R. Asam amino adalah bahan penyusun dasar protein, yang merupakan senyawa organik yang mengandung gugus amino basa dan gugus karboksil asam, dan gugus R adalah gugus keempat yang melekat pada atom karbon asam amino. Molekul asam amino mengandung dua gugus fungsi, gugus amino dan gugus karboksil. Mereka diklasifikasikan ke dalam asam amino yang berbeda sesuai dengan kelompok substituen R. Asam amino protein berbeda secara struktural tergantung pada gen rantai samping R. Asam amino biasanya diklasifikasikan menurut struktur kimia dari kelompok substituen R. Ke-20 asam amino biasanya diklasifikasikan menurut struktur kimia dan sifat gugus R. 1. Asam amino aromatik: fenilalanin, tirosin. 2. Asam amino heterosiklik: histidin, triptofan. 3. Asam amino alifatik: C, Val, Leusin, Isoleusin, Telur, Aspartat, Biji-bijian, Lisin, Arginin, Glisin, Sutra, Belerang, Sistein, Asparagin, Glutamin. 4. Asam subamino heterosiklik: prolin. Alasan keragaman struktur molekul protein adalah perbedaan jenis, jumlah, urutan, dan struktur spasial asam amino.