Ada kemungkinan menstruasi akan kembali normal setelah resistensi insulin sembuh, tetapi hal ini tidak mutlak dan kondisi lain yang menyebabkan menstruasi tidak normal perlu disingkirkan. Resistensi insulin tidak hanya memengaruhi gula darah, tetapi beberapa sistem dalam tubuh juga terpengaruh dalam berbagai tingkat. Jika mempengaruhi kadar estrogen dan progesteron, pasien wanita dapat menunjukkan gangguan menstruasi. Jika resistensi insulin lebih jelas, maka dapat menyebabkan gangguan sekresi estrogen dan progesteron, yang dapat menyebabkan ketidakteraturan menstruasi, baik menstruasi yang banyak maupun yang sedikit, atau pada kasus yang parah, amenorea, yang dapat menyebabkan kemandulan. Menstruasi dapat kembali normal setelah resistensi insulin membaik. Namun demikian, penyakit lain yang menyebabkan menstruasi tidak normal, seperti sindrom ovarium polikistik dan sindrom Cushing, perlu disingkirkan. Pasien dengan resistensi insulin yang mengalami menstruasi tidak normal disarankan untuk segera mendapatkan perawatan medis.