Cacat septum atrium pediatrik yang lebih kecil dapat diobservasi sementara dan ditinjau secara teratur, dan jika pasien tidak membaik pada usia 3 hingga 5 tahun dapat diobati dengan pembedahan atau intervensi. Jika cacatnya besar atau terjadi komplikasi dini seperti gagal jantung, perawatan bedah dapat dibatasi.
Jika defek septum atrium pediatrik berukuran kecil dan gejala klinisnya tidak jelas, bayi dapat diobservasi sementara dan ditindaklanjuti dengan pemeriksaan rutin. Jika defek masih belum tertutup pada usia 3 hingga 5 tahun, maka dapat ditutup dengan “payung jamur” atau diobati dengan pembedahan.
Untuk cacat septum atrium yang lebih besar atau pasien dengan gagal jantung dini, infeksi berulang, dan dampak parah pada pertumbuhan dan perkembangan, anestesi dan detak jantung buatan dapat digunakan untuk jangka waktu terbatas. Perbaikan defek di bawah penglihatan langsung dapat dilakukan untuk jangka waktu terbatas dengan menghentikan sementara aliran darah ke jantung melalui anestesi dan sirkulasi ekstrakorporeal dengan perangkat jantung-paru buatan.
Jika diagnosis defek septum atrium dikonfirmasi, USG jantung tindak lanjut secara teratur dapat dilakukan untuk memeriksa status defek septum atrium jika defeknya kecil, atau intervensi bedah dapat dilakukan sesuai anjuran dokter jika defeknya besar dan terdapat gejala klinis yang jelas.