Efek samping dari suntikan menopause masih relatif banyak. Pertama-tama, lebih mudah menyebabkan efek samping gangguan menstruasi, tetapi juga menyebabkan penyakit ginekologi wanita, karena wanita yang lebih miskin lebih rentan terhadap masalah ginekologi, bagi mereka yang memiliki kondisi fisik yang lebih baik, suntikan menopause sesekali tidak masalah. Suntik menopause yang sering dapat menyebabkan menopause berkepanjangan, yang dalam kasus yang serius dapat menyebabkan kemandulan, dan disarankan agar wanita dengan keadaan khusus dapat menggunakan pil kontrasepsi untuk mencapai tujuan menopause. Kedua, penggunaan suntikan menopause dalam jangka waktu lama dapat dengan mudah mempengaruhi psikologi wanita, dan beberapa wanita mengalami peningkatan tekanan psikologis karena perubahan menstruasi. Terakhir, penggunaan suntikan menopause dalam jangka waktu lama dapat menyebabkan penyakit primer, yang dapat menyebabkan peningkatan keputihan dan peningkatan kemungkinan penyakit ginekologi di klinik.