Tes genetik juga tersedia untuk kanker paru skuamosa. Sekitar 10-20% kanker paru skuamosa juga memiliki mutasi genetik, seperti mutasi EGFR atau mutasi ALK. Insiden mutasi genetik pada kanker paru skuamosa secara signifikan lebih rendah dibandingkan dengan adenokarsinoma paru, dan sekitar 10-20% kanker paru skuamosa di China juga memiliki mutasi genetik. Adanya mutasi genetik menjadi dasar penggunaan obat yang ditargetkan. Pengobatan saat ini untuk kanker paru skuamosa sebagian besar adalah kemoterapi, atau pengobatan seperti penghambat pos pemeriksaan kekebalan tubuh. Jika terdapat mutasi genetik, pengobatan dapat ditingkatkan. Penggunaan obat yang ditargetkan dapat dikonsumsi secara oral, dengan efek samping yang lebih sedikit, efisiensi yang lebih tinggi, dan toleransi yang baik. Pengujian genetik untuk kanker paru skuamosa juga tersedia secara klinis, terutama untuk kanker skuamosa yang tidak merokok.