Saat menangani ovarium polikistik, obat-obatan adalah pengobatan andalan. Jika perawatan bedah diinginkan, perforasi laparoskopi kista ovarium bilateral dapat dilakukan untuk membantu meningkatkan drainase folikel dan mengurangi penebalan kortikal ovarium. Reseksi irisan parsial ovarium juga dapat dilakukan untuk mengurangi beban ovarium yang disebabkan oleh kanker ovarium polikistik. Ada juga risiko yang terkait dengan prosedur ini, karena dapat menyebabkan disfungsi ovarium dan dapat menyebabkan kelainan ovarium yang meningkatkan kemungkinan perlengketan. Oleh karena itu, sebagian besar pasien perlu diobati dengan obat oral. Kecuali pada kasus operasi histerolaparoskopi gabungan, ketika perforasi ovarium bilateral dapat dilakukan. Ketika obat oral diberikan, kadar hormon normal biasanya pulih dalam waktu sekitar 3 bulan atau 6 bulan, dan jika kehamilan diperlukan, obat ovulasi oral dapat diberikan untuk meningkatkan kemungkinan pembuahan.