Gejala cacat septum atrium pada orang dewasa bervariasi dalam tingkat keparahannya, mulai dari tanpa gejala pada kasus yang ringan hingga sesak napas dan kelelahan pada kasus yang lebih parah. Pada kasus yang lebih parah, gejala seperti sesak napas dan kelelahan dapat terjadi. Beberapa kasus dapat disertai dengan sianosis.
Beberapa orang dengan cacat septum atrium ringan mungkin tidak menunjukkan gejala dan hanya terdeteksi pada pemeriksaan. Pada kasus yang lebih parah, gejala seperti jantung berdebar saat beraktivitas, sesak napas, kelelahan, batuk, dan hemoptisis dapat terjadi.
Sebagian besar tidak muncul dengan sianosis, tetapi bila terdapat pirau kanan-ke-kiri, sianosis dapat terjadi, yang mengakibatkan sindrom Eisenmenger. Selain itu, beberapa dapat dikaitkan dengan gejala seperti takikardia supraventrikular paroksismal, atrial flutter, fibrilasi atrium, dan aritmia lainnya.
Jika terdapat defek septum atrium, maka harus ditangani dengan serius dan ditindaklanjuti secara teratur. Jika terdapat ketidaknyamanan, dianjurkan untuk segera mencari bantuan medis untuk diagnosis dan pengobatan.