Ada perbedaan antara minum obat sebelum makan dan setelah makan sebagai berikut. Untuk iritasi selaput lendir saluran pencernaan, obat yang diminum sebelum makan biasanya dipilih yang memiliki sifat protektif pada mukosa lambung. Misalnya, obat-obatan seperti penghambat pompa proton dan senyawa tioglikolat, yang dengan sendirinya memainkan efek perlindungan pada mukosa lambung dan pada saat yang sama memiliki efek menghambat sekresi asam lambung, sehingga meminumnya sebelum makan akan memiliki efek perlindungan pada saluran pencernaan. Penghambat pompa proton, seperti omeprazole dan pantoprazole, dapat dikonsumsi sebelum makan. Obat yang diminum setelah makan biasanya adalah obat yang memiliki tingkat iritasi tertentu pada saluran pencernaan, seperti antibiotik dan NSAID, biasanya sefalosporin, azitromisin, ofloksasin, roksitromisin, ibuprofen, dan lain-lain, yang dapat menyebabkan tingkat iritasi tertentu pada selaput lendir saluran pencernaan dan oleh karena itu diminum setelah makan.