Sakit kepala akibat demam rendah dapat disebabkan oleh beberapa faktor: 1. Faktor infeksi, seperti infeksi bakteri, infeksi virus dan patogen atipikal, infeksi mikoplasma dan klamidia dapat terjadi ketika terdapat gejala klinis dan manifestasi demam rendah, yang dapat disertai dengan sakit kepala. Karena sumber pirogenik di dalam tubuh melepaskan faktor inflamasi, maka faktor inflamasi yang disebut juga dengan inflammatory transmitter, seperti interleukin-6, leukotrien, tumor necrosis factor dan faktor inflamasi lainnya, ketika dilepaskan dan berkeliaran di dalam tubuh akan menimbulkan sakit kepala dan manifestasi klinis berupa nyeri otot dan saraf. Sakit kepala saat demam rendah juga dapat disebabkan oleh faktor non-infeksius, seperti adanya dermatomiositis dan lupus eritematosus sistemik, ketika suhu tubuh tidak tinggi, tetapi akan timbul gejala dan manifestasi klinis berupa nyeri otot dan saraf. Gejala klinis dan manifestasi sakit kepala. 3. Demam rendah yang disertai dengan gejala klinis dan manifestasi sakit kepala juga dapat terjadi pada kasus-kasus dengan kekebalan tubuh yang sangat rendah seperti hipertiroidisme, anemia berat, tumor, dan AIDS.